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检方调查，32岁邱姓女子2002年和同居黄姓男友(33岁)未婚生子，小孩未报户口，户政人员在5年后依户籍法径自为小孩办理出生登记，从母姓；因邱童7岁后仍未就学，区公所人员2年前向警方反应，警察觉得事有蹊跷。
警方追查邱女和黄男，查出邱童竟在2004年就往生，当年是酒店业者“阿波”帮黄男找葬仪社处理，埋尸地点在汐止区第七公墓一处废弃墓穴，今年5月开挖找到邱童骨骸、包遗体的往生被、奶嘴、洋娃娃和几包“乖乖”零食。
检警会同法医相验，邱童尸体仅剩白骨，无法评估死因，仅能确定没有骨折；也由于相关物品腐烂，失去案发第一现场，证物有限，查不出他杀嫌疑。
检方说，邱童在2004年过年时感冒，但邱女和黄男外出摆摊卖烧烤，凌晨返家时发现他已死亡。没有证据证明邱童有遭虐死情况。邱女与黄男对邱童有照护义务，却因黄男遭通缉，不但未将邱童送医，还独留在家致死。